In Linkersys è presente anche uno strumento CRM. Tramite questo strumento è possibile registrare tutte le aziende con cui si entra in contatto per i motivi più disparati (Clienti, fornitori, Partner, ...). E' possibile registrare per ogni azienda l'elenco dei contatti relativi, i contratti stipulati, gli ordini ricevuti, le chiamate pianificate e le opportunità che si sono presentate. Il modulo CRM mette a disposizione funzionalità di ricerca e reportistica e in sinergia con gli altri moduli Linkersys consente di tracciare l'evoluzione delle proprie trattative, seguire l'evolvere dei contatti con lead e prospect.